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Organisation & Gouvernance

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    Exemple

    Plateformes IFB

    Exemple pour le site web de l'IFB. Cette carte n'est pas représentative.

    Comité des tutelles

    L’IFB est une Unité Mixte de Service (UMS), sous la tutelle de cinq organismes de recherche nationaux: 

    • CNRS Centre National de la Recherche Scientifique, représenté par le Directeur de l'INSB, ou son représentant, et Président du COMITE D’ORIENTATION STRATEGIQUE.
    • INRAe Institut National de Recherche sur l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement, 
    • représenté par le Président de l’INRA ou son représentant.
    • Inserm Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, représenté par le Président-directeur général de l'Inserm ou son représentant.
    • CEA Commission des énergies alternatives et de l’énergie atomique, représenté par le Directeur des Sciences du Vivant ou son représentant.
    • INRIA Institut National d’Informatique et de Contrôle , représentée par le Président-directeur général d’Inria ou son représentant.

    Liste des membres à la signature de la révision de l’accord (2 représentants pour le CNRS, une seule voix).

    1. M. Daniel Boujard, représentant du CNRS/INSB
    2. M. Gilles Aumont, représentant de l’INRAE
    3. M. Hugues Berry, représentant de l’INRIA
    4. Mme Laure Sabatier, représentante du CEA
    5. Mme Cathy Nguyen, représentante de l’Inserm
    6. Anne Siégel, représentant du CNRS/INS2I

    Instances de gouvernance

    Afin de parvenir aux résultats d’impact visés, l’IFB a revu sa gouvernance et sa structure directrice. L’organisation se recentre sur des interactions continues avec les autorités qui le supervisent, avec les autres infrastructures nationales « omics », ainsi qu’en accord avec la planification nationale. Ces modifications permettent une dissociation claire entre la stratégie scientifique et la gestion des tâches opérationnelles.

     

    Le Collège de Direction

    Le Collège de Direction (CoDir) de l’IFB est composé du Directeur de l’IFB, du Directeur Adjoint et de trois autres membres de l’IFB ; cette organisation permet la gestion de l’ensemble des projets et propose les orientations scientifiques. Les membres candidats sont soumis par les directeurs de l’IFB, puis nommés par le Collège de Direction, et ce, pour une durée de trois ans. Les réunions de ce directorat ont lieu toutes les deux semaines. Le directorat est aidé par le corps gouvernant de l’IFB constitué de quatre comités en charge de la politique de stratégie scientifique et de trois cellules opérationnelles en charge de la gestion des actions. 

    Le Conseil de Direction

    Le Conseil de Direction de l’IFB est un subalterne du Collège de Direction d’IBISA, restreint à nos 5 « tutelles ». Cette structure n’a aucun lien direct avec le PIA, et sera donc maintenu comme structure gouvernante majeure. Il doit cependant être élargis dans le but de refléter l’évolution de nos institutions partenaires.

    Jusqu’à présent, le Comité de Direction s’est restreint aux organismes de recherche (CNRS, Inserm, INRAe , CEA , INRIA), tandis que 24 de nos plateformes sont affiliées à des universités, parmi lesquelles 7 ont une université comme affiliation majoritaire.  

    Le Comité en Charge de la Stratégie et de l’Orientation Scientifique (CCSO)

    Le Comité en Charge de la Stratégie et de l’Orientation Scientifique (CCSO), constitué de représentants scientifiques des différentes autorités de supervision, un représentant du ministère, les dirigeants des infrastructures nationales et des programmes scientifiques nationaux (e.g. France Médecine Génomique Plan 2025).

    Concernant les infrastructures nationales France Génomique, ProFi, MetaboHUB, Frisbi, France BioImaging, France Life Imaging, Biobanks, EMBRC-FR et Constance sont les premiers concernés. Ce comité définit les principales orientations stratégiques au regard du rapport du Conseil de Consultation Scientifique et des budgets requis y étant associés. Le CCSO interagit régulièrement avec les dirigeants des cellules opérationnelles, supervise les différentes actions et débat des nouvelles orientations aussi souvent que possible. Ce comité doit être mis en place ; il se réunira au minimum une fois par mois. 

     
    Prénom Nom Organisme Rôle Suppléants Email
    Christophe Calvin CEA Tutelle Baptiste Martin Christophe.Calvin@cea.fr
    Christian MUCHARDT CNRS Tutelle insb.das5c@cnrs.fr
    Marie Zins Constance INBS marie.zins@inserm.fr
    Nicolas Pade EMBRC-FR INBS nicolas.pade@sorbonne-universite.fr
    Franck Lethimonnier FMG2025 INBS franck.lethimonnier@inserm.fr
    Jean Salamero France BioImaging INBS jean.salamero@curie.fr
    Pierre Le Ber France Génomique INBS Denis Milan Pleber@genoscope.cns.fr
    Vincent Lebon France Life Imaging INBS Régine Trebossen vincent.lebon@cea.fr
    Bruno Klaholz Frisbi INBS Gilles Labesse klaholz@igbmc.fr
    Hervé Monod INRAE Tutelle herve.monod@inrae.fr
    Hugues Berry INRIA Tutelle hugues.berry@inria.fr
    Catherine Nguyen INSERM Tutelle catherine.nguyen@inserm.fr
    Dominique Rolin MetaboHUB INBS Fabien Jourdan dominique.rolin@inra.fr
    Jacques Le Gouis Phenome/Emphasis INBS Jacques.LEGOUIS@clermont.inra.fr
    Yann Hérault Phenomin/Celphedia INBS herault@igbmc.fr

    Scientific advisory board (SAB).

    The SAB reviews IFB actions and advises the Board of Directors on IFB's scientific strategy. It meets once a year. Its members are appointed by the Board of Directors.

    Prénom Nom Organisme Pays Email Liste
    Amos Bairoch Swiss Institute of Bioinformatics Switzerland Amos.Bairoch@unige.ch Amos Bairoch (Swiss Institute of Bioinformatics, Switzerland)
    Lodewyk Wessels Cancer Systems Biology Center The Netherlands  l.wessels@nki.nl Lodewyk Wessels (Cancer Systems Biology Center, The Netherlands)
    Christine Orengo University College London UK   c.orengo@ucl.ac.uk Christine Orengo (University College London, UK)
    Anton Nekrutenko PennState University USA anton@bx.psu.edu Anton Nekrutenko (PennState University, USA)
    Soren Brunak University of Copenhagen Denmark soren.brunak@cpr.ku.dk Soren Brunak (University of Copenhagen, Denmark)
    Ana Conesa Cegarra University of Florida USA  vickycoce@gmail.com Ana Conesa Cegarra (University of Florida, USA)

    Le Comité d'Éthique

    Le Comité d’Éthique assiste le Directorat de l’IFB sur les questions législatives, d’éthique et sociétales relatives à l’accomplissement d toute activités dans les missions de l’IFB (e.g. protection des données sensible, questions d’éthique liées au génomique personnel…). Il sera constitué de scientifiques et de déontologues. Ses activités incluront les évaluations des problèmes d’éthique, l’organisation de l’intra-IFB et des débats publics ainsi que la communication relative aux questions d’éthique.

    Prénom Nom Organisme Institut Ville Fonction Email
    Gaëlle Bujan CNRS Déléguée à la protection des données dpd@cnrs.fr
    Anne Cambon-Thomsen CNRS Représente le PFMG2025 anne.cambon-thomsen@univ-tlse3.fr
    François Eisinger Inserm Institut Paoli-Calmette Marseille Médecin, Institut Paoli-Calmettes; membre du Comité Ethique Inserm; France Médecine Génomique 2025 eisingerf@ipc.unicancer.fr
    Nathalie Gandon INRAE nathalie.gandon@inra.fr
    Christine Gaspin IFB+INRAE Toulouse Collège direction IFB / Responsable plateforme GenoToul christine.gaspin@inra.fr
    Marc Hanauer Gustave Roussy Resp. pF IFB; projet Orphanet marc.hanauer@inserm.fr
    Claudine Médigue IFB IFB-core Evry Directrice cmedigue@genoscope.cns.fr
    Catherine Nguyen Aviesan TAGC Marseille Directrice ITMO GGB Aviesan catherine.nguyen@inserm.fr
    Jacques Nicolas Inria jacques.nicolas@inria.fr
    Ana Rath Orphanet Strasbourg Responsable Orphanet, médecin + philosophe ana.rath@inserm.fr
    Alice René CNRS / INSB responsable. Cellule Réglementation Bioéthique Alice.RENE@cnrs-dir.fr
    Jacques van Helden IFB IFB-core Orsay Coordinateur Jacques.van-Helden@univ-amu.fr
    Alain Viari INRIA Alain.Viari@inria.fr

    Le Comité de Conseil Industriel

    L’ancienne Cellule de Régulation et Contrôle Qualitatif (CRCQ) est supprimée. L’implémentation de la gestion de qualité de système (ISO9001/NF X50-900), est actuellement réalisé par un groupe de travail qui définit et veille au contrôle des indicateurs de performance. Cette cellule est actuellement composée de deux directeurs, de 5 pilotes du processus définit, et de Marie-Pierre Dubrulle. De plus, l’IFB ne souhaite plus se soumettre au procédé complexe d’obtention de l’Accord d’Hébergement de Données Médicales (Health Data Hosting) en accord avec la législation française, car cet aspect en particulier sera pris en charge par la Direction des Services Informatiques de l'Inserm.

    Au lieu de transférer les données à nos services informatiques, nous développons des stratégies afin de déplacer l’environnement logiciel en amont des données, en collaboration avec les acteurs pertinents (SSI Inserm). Cette stratégie correspond également aux tendances actuelles de partage de données internationales. (e.g. investissement d’ELIXIR au sein du projet 1 million de génomes européen). 

    Prénom Nom Entreprise IFB / ext Pays Email
    Guillaume Boussy BIOASTER ext France Guillaume.BOISSY@bioaster.org
    Frédéric Sapet BIOGEMMA ext France Frederic.SAPET@biogemma.com
    Bruno Lacroix Biomérieux ext France Bruno.LACROIX@biomerieux.com
    Jérôme Wojcik QuartzBio ext Suisse jerome.wojcik@precisionformedicine.com
    Anne Sophie Coquel SANOFI ext France annesophie.coquel@gmail.com
    Charles Loomis Sixsq  ext Suisse cal@sixsq.com
    Patrick Durand Durand IFB, Ifremer IFB France Patrick.Guido.Durand@ifremer.fr
    Christine Gaspin IFB, INRAE IFB France christine.gaspin@inra.fr
    Claudine Médigue IFB, CNRS  IFB  France Claudine.MEDIGUE@france-bioinformatique.fr
    Jacques van Helden IFB, AMU, CNRS IFB France Jacques.VAN-HELDEN@france-bioinformatique.fr
    Yves Vandenbrouck IFB, CEA IFB France yves.vandenbrouck@cea.fr

    La cellule de Valorisation et de Communication

    La cellule de Valorisation et de Communication a été ajoutée. Elle sera constituée de représentants des Services de Valorisation de chaque tutelle de l’IFB (au moins 5 personnes), des directeurs de l’IFB, des coordinateurs de l’action A3.2 (liens avec l’Industrie) ainsi que de la personne en charge de la communication des actions et résultats de l’IFB. Les recommandations du Comité de Conseil Industriel seront utilisées par cette cellule dans le but de prioriser des actions dédiées à la valorisation des services de l’IFB.

    Comité de pilotage

    Claudine Médigue (CNRS, Evry)

    Jacques van Helden (Aix-Marseille Université, Marseille)

    Christine Gaspin (INRAe, Toulouse)

    Julien Seiler (CNRS, Strasbourg) [suppl : Gildas Lecorguillé (CNRS, Roscoff)]

    Christophe Blanchet (CNRS, Lyon) [suppl : Olivier Colin (CNRS, GenOuest)]

    Yves Vandenbrouck (CEA, Grenoble)

    David Salgado (Inserm, Marseille)

    Hélène Chiapello (INRAe, Jouy en Josas)

    • Directeurs de l’IFB : Claudine Medigue & Jacques van Helden

    Représentants des pôles régionaux :

    • IFB-NE : Maude Pupin (U. Lille) / suppléante : Julie Thompson (CNRS)
    • PRABI : Guy Perrière (CNRS) / suppléant : Philippe Veber (CNRS)
    • IFB-GS : Vincent Lefort (CNRS) / suppléant :  Jean-François Dufayard (CIRAD)
    • IFB-SO : Christine Gaspin (INRAe) et Macha Nikolski (CNRS) / suppléant : Alexis Groppi (CNRS)
    • IFB-GO : Olivier Collin (CNRS) et Erwan Corre (CNRS) / suppléant : Audrey Bihoué (CNRS)
    • APLIBIO : Pierre Tuffery (Inserm) et Ivan Moszer / suppléant : Daniel Gautheret (U. Paris Sud)
    • Directeur de l’IDRIS : Denis Girou (CNRS)
    • Directeur de France Génomique : Pierre Le Ber (CEA)

    Invités permanents :

    • Responsable de la cellule Infrastructure de l’IFB-core : Christophe Blanchet (CNRS)
    • Responsables de la cellule Communication, Formation, Valorisation de l'IFB-core : Victoria Dominguez Del Angel (CNRS) & Suzanne Lauriou (CNRS)
    • Administrateur et gestionnaire de l’IFB-core : Valentin Saint-Léger (CNRS) 

     

    Retrouvez tous les compte-rendus de réunions sur le Wiki de l'IFB. Cet espace Renater est accessible, via les logins institutionnels, à tous les membres des plateformes et les personnes intéressées par notre activités et qui sont référencées dans la liste de diffusion de l'IFB. Pour demander votre ajout à cette liste, contactez-nous. 

    Partenaires

    D’autres établissements-partenaires sont aussi liés à l’IFB car ils sont les tutelles de certaines plateformes constitutives de l’IFB, c’est le cas pour: 

    • Institut Pasteur
    • Institut Curie
    • ICM Institut du Cerveau et de la Moelle épinière
    • Cirad La recherche agronomique pour le développement
    • IRD Institut de Recherche pour le Développement
    • Et quelques universités françaises

     

    L’IFB est l'une des infrastructures nationales de support à la recherche, spécialisées en Biologie et Santé (INBS- Infrastructure nationale en biologie et santé). Les INBS ont de fortes interactions mutuelles, renforcées par l’IFB qui se situe au carrefour de l’utilisation de données de différents types faisant toutes appel à la bioinformatique. Le grand enjeu de la biologie est d’intégrer les données de natures diverses et d’avoir une vision systémique des organismes. L’IFB y participe en collaborant étroitement avec:

    • France Génomique infrastructure nationale en génomique (séquençage)
    • MetaboHub infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique
    • ProFi infrastructure nationale en protéomique
    • FBI France BioImaging
    • FLI France Life Imaging
    • FRISBI infrastructure nationale en bioinformatique structurale
    • EMBRC-FR infrastructure nationale en ressources biologiques marines

    Feuille de route / Workpackages

    WP1. Environnement national distribué de services en bioinformatique

    • Action 1.1 - Réseau National de Ressources Informatiques (NNCR, National Network of Computational Resources)
       Direction: Julien Seiler & Christophe Blanchet
    • Action 1.2 - Environnement des logiciels et des données: intergiciels, outils et flux de travail
      Direction: Gildas Le Corguilé & Olivier Collin
    • Action 1.3 - Soutien aux bases de données
      Direction: Claudine Médigue & Guy Perrière

    • Action 1.4 - Catalogue des ressources françaises en bioinformatique
      Direction: Hervé Ménager & Jacques van Helden
    • Action 1.5 - Accès aux utilisateurs finaux
      Direction: Christine Gaspin & Erwan Corre

    • Action 1.6 - Partage de services avec d’autres infrastructures nationales de soutien à la recherche
      Direction: Christophe Bruley & Jean-françois Dufayard

    • Action 1.7 - Guichet de conseil et d’orientation
      Direction: Vincent Lefort & Ivan Moszer

     

    WP2. Innovation: vers la bioinformatique intégrative

    • Action 2.1 - Projets pilotes en collaboration avec les infrastructures et les plans de recherche nationaux
      Direction: Claudine Médigue, Etienne Thévenot & Olivier Sand
    • Action 2.2 - Appel aux défis et au déblocage des barrières technologiques et scientifiques
      Direction: Ivan Moszer & Jacques van Helden
    • Action 2.3 - Catalyser l’interopérabilité et l’intégration entre les ressources bioinformatiques
      Direction: Alban Gaignard & Marie-Dominique Devignes

     

    WP3. Liens avec les réseaux internationaux et l’industrie

    • Action 3.1 - L’IFB comme noeud français du réseau européen ELIXIR
      Direction: Anne-Françoise Adam-Blondon & Claudine Médigue
    • Action 3.2 - Partenariat avec les industries
      Direction: Patrick Durand & Yves Vandenbrouck

     

    WP4. Formation et sensibilisation

    • Action 4.1 - Formation
      Direction: Hélène Chiapello & Jacques van Helden

    • Action 4.2 - Co-organisation des activités scientifiques avec la SFBI et le GDR BIM
      Direction: Morgane Thomas-Chollier (présidente SFBI) & Hélène Touzet (coordinatrice GDR BIM)
    • Action 4.3 - Communication & Valorisation
      Direction:  Claudine Médigue & Victoria Dominguez Del Angel

     

    WP5. Management et gouvernance

    • Action 5.1 - Organes de gouvernance et de coordination
      Direction: Claudine Médigue & Jacques van Helden
    • Action 5.2 - Système de gestion de la qualité
      Direction: Claudine Médigue
    • Action 5.3 - Modèle économique de l’IFB
      Direction: Claudine Médigue
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    Tab Content #4
    Accordion Item
    Bacon ipsum dolor amet turkey andouille chislic ham hock. Sirloin fatback pastrami pork belly picanha turkey leberkas capicola. Hamburger pastrami cupim short loin tail, alcatra meatball biltong strip steak shankle picanha pork belly pancetta. Meatball strip steak jerky beef porchetta, kevin pig pancetta shank frankfurter chislic rump bresaola hamburger. Swine salami pancetta pork loin shankle rump.

    Ham porchetta shoulder swine, chuck pancetta short ribs t-bone chislic salami andouille ham hock hamburger tail capicola. Kielbasa swine strip steak, spare ribs turkey tenderloin prosciutto meatloaf leberkas t-bone sirloin buffalo. Short ribs tenderloin bresaola, venison corned beef boudin ribeye flank drumstick beef. Sausage pork loin meatball, flank swine alcatra short loin brisket pastrami pig bacon t-bone filet mignon.
    Accordion Item
    Spicy jalapeno bacon ipsum dolor amet shankle spare ribs bresaola, tenderloin frankfurter doner rump. Turkey tenderloin jerky kevin pork loin. Frankfurter rump tongue landjaeger, pork buffalo sirloin. Pig cupim sausage biltong meatball tongue hamburger t-bone cow shank pancetta burgdoggen. Tail kielbasa meatloaf pork chop kevin ham hock frankfurter turducken brisket alcatra tenderloin jerky pig.

    Pork loin tongue short loin short ribs, doner ham hock salami. Doner sirloin corned beef, burgdoggen landjaeger capicola meatball pork belly beef ribs. Pork chop beef corned beef frankfurter. Beef ribs bacon ball tip, spare ribs pancetta jerky pork belly tail. Ball tip tail alcatra pork loin burgdoggen, kielbasa landjaeger. Ground round hamburger tongue, sirloin leberkas pork loin prosciutto chuck cow short loin rump shank filet mignon pork chislic.
    Accordion Item
    Spicy jalapeno bacon ipsum dolor amet shankle spare ribs bresaola, tenderloin frankfurter doner rump. Turkey tenderloin jerky kevin pork loin. Frankfurter rump tongue landjaeger, pork buffalo sirloin. Pig cupim sausage biltong meatball tongue hamburger t-bone cow shank pancetta burgdoggen. Tail kielbasa meatloaf pork chop kevin ham hock frankfurter turducken brisket alcatra tenderloin jerky pig.

    Pork loin tongue short loin short ribs, doner ham hock salami. Doner sirloin corned beef, burgdoggen landjaeger capicola meatball pork belly beef ribs. Pork chop beef corned beef frankfurter. Beef ribs bacon ball tip, spare ribs pancetta jerky pork belly tail. Ball tip tail alcatra pork loin burgdoggen, kielbasa landjaeger. Ground round hamburger tongue, sirloin leberkas pork loin prosciutto chuck cow short loin rump shank filet mignon pork chislic.
    IFB - Institut Français de Bioinformatique ♦ CNRS UMS 3601 ♦ IFB-Core, Génoscope - 2 rue Gaston Crémieux, 91057 - ÉVRY – CEDEX ANR-11-INBS-0013236
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